2009年重庆医科大学陆续开展附属黄水康复医院立项、征地、勘界、环评等前期相关工作，并分别向重庆市教育委员会及重庆卫生局报送《重庆医科大学关于建设附属黄水康复医院的请示》（重医大〔2009〕138号）、《重庆医科大学关于建设附属黄水康复医院的请示》（重医大〔2009〕152号）。2009年11月中下旬重庆市教育委员会下发《关于重庆医科大学建设附属黄水康复医院的批复》（渝教计[2009]36号），重庆市卫生局下发《关于同意重庆医科大学征地建设附属黄水康复医院的批复》（渝卫规财[2009]175号）。